Еще с 90-х гг. ХХ века в Республике Алтай быстрыми темпами идет процесс расслоения на богатых и бедных. В регионе наблюдается резкое отличие в уровне жизни жителей сельских районов и горожан. Сельское население, составляющее три четверти от всего населения республики, в результате реформ оказалось в наиболее сложном экономическом положении. Полный развал колхозно-совхозной системы, отсутствие собственного опыта в налаживании индивидуального хозяйствования, а также отсутствие средств для начала организации собственного хозяйства привели к резкому падению уровня жизни сельских жителей.
Республика Алтай обладает большим природным потенциалом - гидроресурсы, минеральное сырье, лес, значительные рекреационные ресурсы для отдыха и туризма. Однако их эффективное использование затруднено из-за сложной адаптации населения республики к рыночным условиям хозяйственной деятельности, из-за низких стартовых показателей социального и экономического развития к началу экономических реформ, значительной удаленности от центра, недостаточной развитости инфраструктуры, дефицита квалифицированных кадров, необходимости соблюдения экологических ограничений с целью сохранения уникального природного потенциала республики.