Правобережные притоки - Подкаменная и Нижняя Тунгуски, Ангара, Курейка (835 км) - имеют горный и полугорный характер и протекают в узких и глубоких долинах Средне-Сибирского плоскогорья. Течение их изменчиво. По осадочным породам, широким долинам реки текут спокойно, плавно, в местах сужения долины русло становится порожистым, течение бурным. В ихтиофауне преобладают хариус, ленок, тугун, щука, окунь, елец и налим. Встречаются осетр и стерлядь.
В бассейне Енисея более 184 тыс. озер общей площадью 32438 км², свыше 20 тыс. рек общей длиной 316 тыс. км. Из общего речного и озерного фонда реки длиною до 10 км и озера до 1 км² (100 га) составляют основное большинство (более 90%). Крупных водоемов немного. Так, только 66 озер имеют площадь более 1000 га (10 км²) и 20 рек с длиной свыше 500 км.
Ангара (в нижнем течении Верхняя Тунгуска) является самым большим притоком Енисея; она вытекает из оз. Байкал и впадает в Енисей справа, выше г. Енисейска. Наиболее крупные левосторонние притоки Ангары - Иркут, Китой, Белая, Ока, Уда, Бирюса; правосторонние притоки небольшие - Ушаковка, Куда, Ида, Оса, Уда, Илим.самой большой из них является река Тасеева, образующаяся от слияния pек Чуна и Она и впадающая в Ангару в 70 км от устья; ее площадь водосбора равна 131000 км2.
Или́м — река в Иркутской области, правый приток Ангары, впадает в Усть-Илимское водохранилище. Название связывают с якутским «илим» (рыболовная сеть). Его притоки – малые реки Коченга, Чора, Ирек, Турыга.[13]
Еще одной крупной рекой является Селенга, которая представляет собой степную реку с низкими берегами и неустойчивым руслом, расчленяющимся на многочисленные рукава. Места, где сеть рукавов особенно густа, носят название разбоев. Селенга пересекает гористую область Селенгинской Даурии; здесь долина ее представляет чередование суженных участков и межгорных расширений, где русло блуждает среди широкой поймы, делясь на многочисленные протоки. Основным притоком Селенги является река Орхон, также pеки Никой, Хилок и Уда.
Средняя, или Подкаменная Тунгуска - третий по величине правый приток Енисея, впадающий в него между Верхней и Нижней Тунгусками.
Лена (по-якутски - Улахан-Юрях - Большая река) берет начало на западном склоне Байкальского хребта, в 7 км от западного берега Байкала; до г. Якутска течет в основном на северо-восток, а ниже, вплоть до устья, - в меридиональном направлении и ниже с. Булун впадает в море Лаптевых.
Витим - большой правый приток Лены; длина его равна 1820 км, площадь водосбора 227000 км2. Бассейн Витима расположен в горной стране, образованной платообразными возвышенностями и рядом параллельных хребтов - Яблоновым, Улан-Бургассы, Южно- и Северо-Муйским.
Олекма, так же как и Витим, является крупным правобережным притоком Лены. Длина ее 1810 км, площадь водосбора 201000 км2. Река протекает большей частью по дну глубокой и узкой долины, сжатой горами; в русле здесь часты пороги, где скорость течения достигает 3-4 м/сек.
Алдан - правый приток Лены Главными притоками Алдана являются: справа - Учур и Мая, слева – Амга.[14]
Наибольшим из притоков по площади водосбора является р. Мая значительно отличающаяся по характеру течения от других рек Якутии. Она течет преимущественно по дну широкой и заболоченной долины, где русло делится на многочисленные рукава. На протяжении 640 км вверх от устья Мая доступна для судоходства.
В гидрографическом отношении интересен узкий и длинный бассейн р. Амги, расположенный между Леной и Алданом. При длине реки в 1650 км средняя ширина бассейна равна около 97 км.
Вилюй - второй по величине, после Алдана, приток Лены; он берет начало в области Средне-Сибирского плоскогорья и впадает в Лену слева, в 300 км ниже г. Якутска. Длина реки 2430 км, площадь водосбора 491000 км2.
Яна принадлежит к числу значительных рек Восточной Сибири; ее длина равна 1170 км. Яна образует сложную сеть проток, наиболее значительными из которых являются Правая и Ильин Шар.
Индигирка - приток Восточно-Сибирского моря, впадает в него ниже с. Аллайхи - образуется от слияния pp. Хастах и Тарын-Юрях; большей из них является Хастах, которая и может считаться за главный исток Индигирки. Длина реки 1790 км, площадь водосбора 360000 км2.
Большинство малых водотоков восточно-сибирского района относится к типу рек преимущественно снегового питания, доля которого превышает 50% годового стока. Дождевое питание играет второстепенную роль, а грунтовое в условиях вечной мерзлоты очень скудное и составляет лишь 1-2% от общего годового стока.[15] Основной сток на малых реках Восточной Сибири проходит в теплый период года, на долю зимнего стока приходится лишь несколько процентов от общего годового его объема. В целом для режима рек Восточной Сибири характерны следующие основные признаки: высокое весеннее половодье, за которым непосредственно следует ряд летних паводков от дождей, по своей высоте, однако, значительно уступающих весеннему половодью, и, наконец, низкий сток в зимний период вплоть до полного его прекращения.